SCI论文：

　　1. Yan S, Yan CJ, Zeng XH, Yang YC, Fang YW, Tian CY, Sun YW, Cheng ZK, Gu MH*. ROLLED LEAF 9, encoding a GARP protein, regulates the leaf abaxial cell fate in rice. Plant Molecular Biology,, 2008,68:239–250

　　2.Li AH, Zhang YF, Wu XJ, Tang W, Wu R., Dai ZY, Liu GQ, Zhang HX, Wu CY, Chen G, Pan XB *: DH1, a LOB domain-like protein required for glume formation in rice, Plant Molecular Biology, 2008, (66): 491–502

　　3. Yang SM, Gao MQ, Xu CW, Gao JC, Deshpande S, Lin SP, Roe B., and Zhu HY*. Alfalfa benefits from Medicago truncatula: The RCT1 gene from M. truncatula confers broad-spectrum resistance to anthracnose in alfalfa. Proc Natl Acad Sci USA, 2008 105(34): 12164-12169 [**]

　　4.Yang ZF, Gu SL, Wang XF, Li WJ, Tang ZX, Xu CW*. Molecular evolution of the cpp-like gene family in plants: insights from comparative genomics of arabidopsis and rice. Journal of Molecular Evolution, 2008，67（3）：266-271

　　5.Yang ZF, Wang XF, Gu SL, Hu ZQ, Xu H, Xu CW*. Comparative study of sbp-box gene family in arabidopsis and rice. Gene, 2008, 407: 1-11

　　6.Wang XF, Hu ZQ, Wang W, Li YL, Zhang Y-M, Xu CW*. A mixture model approach to the mapping of qtl controlling endosperm traits with bulked sample. Genetica, 2008, 132: 59-70

　　7. Yang ZF, Zhou Y, Gu SL, Yu JM, Liang GH, Yan CJ, Xu CW*. Genome-wide comparative phylogenetic and molecular evolutional analysis of TUBBY-like protein family in Arabidopsis, rice and poplar. Genomics, 2008, 92(4): 246-253

　　8.Martin AY, Chen XH*, Liang GH, Gu MH, Xu CW. Inheritance of waterlogging tolerance in cucumber. Euphytica, 2008, 162: 145-154

　　9.Zhu SQ, Zhao H, Liang JS, Ji BH, Jiao DM*. Relationships between phosphatidylglycerol molecular species of thylakoid membrane lipids and sensitivities to chilling-induced photoinhibition in rice (Oryza sativa L.). Journal of Integrative Plant Biology 2008, 50(2): 194-202 [**]

　　10. Lü B, Guo ZG, Liang JS*. Effects of the activities of key enzymes involved in starch biosynthesis on the fine structure of amylopectin in developing rice (Oryza sativa L.) endosperms. Science in China (Series C). 2008, 51(10):863-871

　　11.Wang YJ, Yin GM, Yang Q, Tang JH, Lu XM, Korban SS, Xu ML*. Identification and isolation of Mu-flanking fragments from maize, Journal of Genetics and Genomics, 2008, 35(4): 207-213

　　12. Zuo SM, Zhang L, Wang H, Yin YJ, Zhang YF, Chen ZX, Ma YY, Pan XB*: Prospect of the QTL-qSB-9Tq utilized in molecular breeding program of japonica rice against sheath blight, Journal of Genetics and Genomics, 2008, 35 (8): 499-505

　　13.Yu HX, Wang X, Gong ZY, Tang D, Gu MH, Cheng ZK*. Generating of rice OsCENH3-GFP transgenic plants and their genetic applications. Chinese Science Bulletin, 2008, 53: 2981-2988

　　14.Yi CD, Tang SZ, Zhou Y, Liang GH, Gong ZY, Gu MH*.  Development and characterization of interspecific hybrids between Oryza sativa and O. latifolia by in situ hybridization. Chinese Science Bulletin, 2008, 53(19): 2973-2980

　　15.Guo X, Li H, Gong ZY, Zhang FM, Zheng SY, Guo R*. Micelle-to-vesicle transition induced by oligonucleotide in sds/deab mixed system with a net negative charge, Journal of Polymer Science: Part A: Polymer Chemistry, 2008, 46: 7491-7504 [**]

  　16.Gong ZY, Gao QS, Yu HX, Yi CD, Gu MH*. Molecular-cytological identification and chromosome behavoir analysis of telotetrasomic in rice, Rice Science, 2008, 15(3):161-165

　　17. Yi CD, Cheng X, Wang BB, Liang GH, Gong ZY, Tang SZ, Gu MH*. Molecular cytogenetic analysis of spontaneous interspecific hybrid between Oryza sativa and Oryza minuta. Rice Science, 2008, 15(4): 283-288

　　18.Mao HY, Pan CH, Chen ZX, Zhang YF, Zuo SM, Chen JR, Pan XB*: Discorery and Preliminary studies on a rapid-leafing rice genotype at the vegetative growth stage, Rice Science, 2008, 15(1): 29-35

　　19. Wei CX, Zhang J, Zhou WD, Chen YF. Xu RG*. Development of small starch granule in barley endosperm. Acta Agronomica Sinica, 2008, 34(10): 1788–1796

　　20.Wei CX, Xie PS, Zhou WD, Chen YF, Yan CJ*, Anatomical structure and chemical features of leaf in brittle mutant of rice. Acta Agronomica Sinica, 2008, 34(8): 1417−1423

　　21.Wang YJ, Xu ML*, Deng DX, Bian YL. Maize Mutator transposon, Frontiers of Agriculture in China, 2008, 2(4): 396-403

　　22. Xiao J, Wang XF, Yang ZF, Xu CW*. Comparison of supervised clustering methods for the analysis of DNA microarray expression data. Agricultural Sciences in China, 2008, 7(2): 129-139

　　23.Tang ZX, Xu CW*. Advances in research of strategies and methods for analyzing complex traits. Agricultural Sciences in China, 2008, 7(7):775-788

　　 

　　非SCI论文：

　　1. 王歆, 于恒秀, 龚志云, 唐丁, 顾铭洪, 程祝宽*. (2008). OsCENH3-GFP 融合转基因水稻的获得及其遗传应用. 科学通报, 53(16), 1902-1908

　　2. 裔传灯, 汤述翥, 周勇, 梁国华, 龚志云, 顾铭洪*. (2008). 栽培稻与宽叶野生稻种间杂种的获得及其原位杂交分析. 科学通报, 53(17): 2047-2053

　　3.龚志云，于恒秀，苏艳，裔传灯，顾铭洪*. (2008). 水稻无性繁殖过程中第8号染色体单体的发现及其分子细胞学鉴定. 自然科学进展, 18（12）1507-1512

　　4.马玉银，李磊，李育红，左示敏，殷跃军，张亚芳，陈宗祥，潘学彪*. 一个新的水稻隐性高秆突变体的遗传分析和基因定位，中国农业科学，2008，41 (12)：3967-3973

　　5. 汤在祥，徐辰武*. 复杂性状遗传基础研究进展. 中国农业科学，2008，41(5):1255-1266

　　6.莫惠栋*, 许如根. 田间试验的一种新设计——数独方. 作物学报. 2008, 34(9):1489-1493

　　7.韦存虚，张军，周卫东，陈义芳，许如根*. 大麦胚乳小淀粉粒的发育. 作物学报. 2008, 34(10):1788-1796

　　8.韦存虚，谢佩松，周卫东，陈义芳，严长杰*. 水稻脆性突变体叶的解剖结构和化学特性, 作物学报, 2008, 34(8): 1417−1423

　　9. 王学枫，汤在祥，王亚民，宋雯，徐辰武*. 基于NCIII和TTC设计的胚乳性状区间作图方法. 作物学报，2008，34(10):1734-1743

　　10.龚志云, 高清松，于恒秀，裔传灯，顾铭洪*. (2008). 水稻端四体材料的分子细胞学鉴定及其染色体行为分析. 中国水稻科学，22（4）：335～339

　　11. 敖雁，胡治球，汤在祥，王学枫，徐辰武*. 多亲本杂交衍生的多个相关群体QTL作图的通用方法. 中国水稻科学, 2008 22(4):

　　12.敖雁，胡治球，徐辰武*. 多亲本杂交衍生的多个相关群体QTL图谱的联合构建方法. 中国水稻科学，2008，22(4):427-431

　　13.韦存虚，张　军，周卫东，陈义芳，刘巧泉*. 水稻胚乳淀粉体被膜的降解和复粒淀粉粒概念的探讨，中国水稻科学，2008, 22(4): 377~384

　　14.陈红旗，陈宗祥，倪深，左示敏，潘学彪*，朱旭东. 利用分子标记技术聚合3个稻瘟病基因改良金23B的稻瘟病抗性，中国水稻科学，2008，22 (1)：23～27

　　15.殷跃军，左示敏，王辉，陈宗祥，马玉银，张亚芳，顾世梁，潘学彪*. 利用近等基因系研究3个抗水稻纹枯病QTL的聚合效应，中国水稻科学，2008，22（4）：340-346

　　16.马玉银，张亚芳，潘存红，李爱宏，吴旭江，左示敏，陈宗祥，吴昌银，潘学彪*. 水稻小粒矮突变性状与T-DNA插入标签的共分离检测，中国水稻科学，2008，22（6）：571～577

　　17.李大红，刘卉，杨艳丽，甄萍萍，梁建生*. RNA干涉下调 RACK1基因表达增强水稻抗旱能力. 中国水稻科学，2008，22(5): 447~453

　　18.李大红，刘卉，杨艳丽，甄萍萍，梁建生*. 转反义OsRACK1基因增强水稻抗旱能力. 植物学报，2008，25 (6): 648~655.

　　19.刘巧泉*，周丽慧，王红梅，顾铭洪. 水稻种子贮藏蛋白合成的分子生物学研究进展，分子植物育种，2008，6(1): 1-15

　　20.王 歆，于恒秀，曾燕楠，刘巧泉，龚志云，程祝宽*. 农杆菌介导籼稻中籼3037转化体系的优化及其应用，分子植物育种，2008，6(3): 457-464

　　21.肖静，王学枫，徐辰武*. 基于DNA微阵列数据的基因聚类方法. 生物医学工程学杂志，2008，25(3):729-733

　　22.王亚民，汤在祥，徐辰武*. 种子性状遗传研究进展. 种子，2008，27(7):42-50

　　23.王亚民，孙长森，汤在祥，胡治球，徐辰武*. 谷物胚乳性状QTL区间作图的贝叶斯方法. 扬州大学学报（农业与生命科学版），2008，29(3): 12-17

　　24.汤述翥*; 张宏根; 张祖建; 梁国华; 严长杰; 刘巧泉; 裔传灯; 李欣; 朱庆森; 顾铭洪; 中国江苏和日本粳稻不育系主要性状的配合力分析，扬州大学学报（农业与生命科学版），2008, 29(1): 56-60

　　25.王歆, 于恒秀, 唐丁, 裔传灯, 程祝宽*. (2008). RNA干涉水稻端粒酶再生植株的初步研究. 扬州大学学报（农业与生命科学版）, 29(4):54-58

　　26.于恒秀, 周美艳, 王淼, 刘巧泉, 黄祖六, 龚志云, 梁国华, 顾铭洪*. 利用二次正交旋转组合设计优化芍药胚苗快繁的培养基，扬州大学学报（农业与生命科学版），2008，29(4)：84-89

　　27.王 玲，于恒秀，黄世文，赵志鹏，龚志云，汤述翥，顾铭洪，刘巧泉*. 抗褐飞虱和抗除草剂转基因粳稻新品系的选育及其中间试验，扬州大学学报（农业与生命科学版），2008, 29(3): 23-27

　　28.李钱峰, 蒋美艳，于恒秀，辛世文，顾铭洪，刘巧泉*. 水稻胚乳RNA定量RT-PCR分析中参照基因选择，扬州大学学报（农业与生命科学版），2008, 29(2): 61-66

　　29.李爱宏，戴正元，季红娟，张小祥，李育红，潘存红，张洪熙*，潘学彪*. 不同基因型水稻种质对黑条矮缩病抗性的初步分析，扬州大学学报（农业与生命科学版），2008，29（3）：18-22

　　30.汤述翥*，张宏根，朱正斌，刘超，顾铭洪，红莲型不育细胞质应用于粳稻杂种优势利用的思考与实践，中国农业信息2008，8：19-20

　　31.汤述翥*，梁国华，严长杰，刘巧泉，于恒秀，陆驹飞，裔传灯，龚志云，张宏根，顾铭洪，优质抗病不育系陵风A及其杂交粳稻陵风优18的选育，江苏农业科学，2008，1：67-69

　　32.汤述翥*，张宏根，梁国华，严长杰，刘巧泉，顾铭洪，三系杂交粳稻发展缓慢的原因及对策，杂交水稻, 2008, 23(1): 1-5

　　33.王小虎，邓德祥*，用叶片和种子DNA对玉米M5P型与YII-1型雄性不育细胞质进行归群，玉米科学，2008，02

　　34. 韦存虚，张军， 周卫东，陈义芳，许如根*. 小麦胚乳小淀粉粒是复粒淀粉的结构观察. 麦类作物学报. 2008, 28(5): 804-810

　　35. 许如根*，吕超， 何为志，赵田芬，王怡. 优质高产啤酒大麦新品种扬农啤6号的选育. 大麦与谷类科学. 2008

　　36.严松，严长杰*，顾铭洪. 植物叶发育的分子机理. 遗传. 2008, 30（9）：1127-1135

　　37.陈峰, 张正球, 张士永, 张洪瑞, 杨连群, 严长杰*. 稻米淀粉的生物合成与品质改良的研究进展. 山东农业科学, 2008, 3: 20-25

　　38.龚志云*，裔传灯，于恒秀. (2008). 植物体细胞无性系变异的研究进展. 中国农学通报, 24（7）65-68

　　39.李 敏，朴建华，刘巧泉，杨晓光. 富含抗性淀粉转基因大米对大鼠肠道健康的影响，营养学报，2008，30(6)：588-591[**]