SCI论文：

　　1. Wang XF, Xu CW*, Wu RL, Larkins B. Genetic Dissection of Complex Endosperm Traits. Trends in Plant Science, 2009,14(7): 391-398 .

　　2. Tian ZX, Qian Q, Liu QQ, Yan MX, Liu XF, Yan CJ, Liu GF, Gao ZY, Tang SZ, Zeng DL, Wang YH, Yu JM, Gu MH* & Li JY. Allelic diversities in rice starch biosynthesis lead to a diverse array of rice eating and cooking qualities. Proc Natl Acad Sci USA, 2009, 106: 21760–21765

　　3. Zhou Y, Zhu JY, Li ZY, Yi CD, Liu J, Zhang HG, Tang SZ, Gu MH, and Liang GH*. (2009) Deletion in a Quantitative Trait Gene qPE9-1 Associated with Panicle Erectness Improves Plant Architecture during Rice Domestication. Genetics 183: 315 - 324.

　　4. Guo JJ, Wang SC, Wang JB, Huang WD, Liang JS, and Chen JG*. Dissection of the Relationship Between RACK1 and Heterotrimeric G-Proteins in Arabidopsis. Plant and Cell Physiology 2009, 50: 1681-1694; [**]

　　5. Tang T, Xie H, Wang YX, Lü B, and Liang JS*. The effect of sucrose and abscisic acid interaction on sucrose synthase and its relationship to grain filling of rice (Oryza sativa L.). Journal of Experimental Botany 2009，60: 2641-2652

　　6. Guo JJ, Wang JB, Xi L, Huang WD, Liang JS, and Chen JG*. RACK1 is a negative regulator of ABA responses in Arabidopsis. Journal of Experimental Botany. 2009 60: 3819-3833 [**]

　　7. Li QF, Zhang GY, Dong ZW, Yu HX, Gu MH, Sun SSM, Liu QQ*. Characterization of the expression of OsPUL gene encoding a pullulanase-type debranching enzyme during seed development and germination in rice. Plant Physiology and Biochemistry, 2009, 47(5): 351-358

　　8. Yan CJ, Yan S, Yang YC, Zeng XH, Fang YW, Zeng SY, Tian CY, Sun YW, Tang SZ & Gu MH *. Development of gene-tagged markers for quantitative trait loci underlying rice yield components. Euphytica, 2009, 169:215-226

　　9. Yu HX, Liu QQ*, Xu L, Lu MF, Yang XJ, Gong ZY, Cai XL, Zhang YS, Zhang CQ, Wang ZY and Gu MH. (2009). Quality characteristics and field performance of selectable marker-free transgenic rice with antisense Wx gene and improved quality derived from the elite parents of hybrid indica rice. Journal of Cereal Science, 50: 370–375

　　10. Yu HX, Yao QH, Wang L, Zhao ZP, Gong ZY, Tang SZ, Liu QQ* and Gu MH.(2009). Generation of selectable marker-free transgenic rice resistant to chewing insects using two co-transformation systems. Progress in Natural Science, 19: 1485-1492

　　11. Gong ZY, Yu HX, Huang J, Yi CD, Gu MH*. (2009). Unstable transmission of rice chromosomes without functional centromeric repeats in asexual propagation. Chromosome research, 17：863-872

　　12. Wang KJ, Tang D, Wang M, Lu JF, Yu HX, Liu J, Qian BX, Gong ZY, Wang X, Chen JM, Gu MH, Cheng ZK*. (2009). MER3 is required for normal meiotic crossover formation, but not for presynaptic alignment in rice. J. Cell Science. 122: 2055–2063.［**］

　　13. Huang J, Zhang KW, Shen Y, Huang ZJ, Li M, Tang D, Gu MH, Cheng ZK* (2009). Identification of a high frequency transposon induced by tissue culture, nDaiZ, a member of the hAT family in rice. Genomics 93: 274-281［**］

　　14. Li T and Bai GH*. Lesion mimic associates with adult plant resistance to leaf rust infection in wheat. Theoretical and Applied Genetics 2009 119(1): 13-21 [**]

　　15. Wu SJ, Zhong H, Zhou Y, Zuo H, Zhou LH, Zhu JY, Ji CQ, Gu SL, Gu MH, Liang GH*. (2009) Identification of QTLs for the resistance to rice stripe virus in indica rice variety Dular. Euphtica, 165:557-565.

　　16. Zhou Y., Shi J., Hu J., Wang J., Zhou L., Gu M., Liang G *. Positional cloning of the rice tillering dwarf gene d10 that encodes a carotenoid cleavage dioxygenase 8/OsCCD8. Progress in Natural Science 2009, 19(12):1683-1689

　　17. Xu CW, Wang XF, Li ZK, Xu SZ*. Mapping QTL for Multiple Traits Using Bayesian Statistics. Genetics Research, 2009, 91: 23–37

　　18. Yang ZF, Gao QS, Sun CS, Li WJ, Gu SL, and Xu CW*. Molecular evolution and functional divergence of HAK potassium transporter gene family in rice (Oryza sativa L.). Journal of Genetics and Genomics, 2009, 36 (3): 1-12

　　19. Wang XF, Song W, Yang ZF, Wang YM, Tang ZX, and Xu CW*. Improved Genetic Mapping of Endosperm Traits Using NCIII and TTC Designs. Journal of Heredity, 2009:100(4):496–500

　　20. Yang ZF, Gu SL, Wang XF, Li WJ, Tang ZX, Xu CW*. Molecular evolution and functional divergence of sulfate transporter gene family in plants. Proceedings of the 2009 2nd International Conference on BioMedical Engineering and Informatics, 2009, 4:1881-1887

　　21. Xu CW*. Improved Genetic Mapping of Endosperm Traits Using NCIII and TTC Designs. Proceedings of Joint 14th Australasian Plant Breeding Conference and 11th SABRAO congress, Cairns, Australia, 10-14 August, 2009

　　22. Yin, Y. J.*, Zuo, S. M.*, Wang, H., Chen, Z. X., Gu, S. L., Zhang, Y. F., and Pan, X. B.*. (2009). Evaluation of the effect of qSB-9(Tq) involved in quantitative resistance to rice sheath blight using near-isogenic lines. Canadian Journal of Plant Science, 89(4): 731-737

　　23. Ao Y, Hu ZQ, Tang ZX, Wang XF, Xu CW*. A general ethod for QTL mapping in multiple related populations derived from multiple parents. Rice Science, 2009, 16(1): 45-50

　　24. Yu HX, Liu QQ*, Xu Li, Lu MF, Cai XL, Gong ZY, Yi CD, Wang ZY, Gu MH*. Breeding and field performance of novel soft and waxy transgenic rice lines without selectable marker, Acta Agronomica Sinica, 2009, 35(6): 967–973

　　25. Chen F, Zhou JH, Zhang SY, Yan CJ, Zhu WY, Sun YW, Yuan SJ, Yang LQ*. Marker-Assisted Selection for Stv-bi Gene Controlling Resistance to Rice Stripe Disease. Acta Agronomica Sinica,2009, 35(4):597-601 [**]

　　26. Wang YM, Kong WQ, Tang ZX, Lu X, Xu CW*. Bayesian Statistics-Based Multiple Interval Mapping of QTL Controlling Endosperm Traits in Cereals. Acta Agronomica Sinica，2009，35（9）：1569-1575

　　27. Deng DX*, Jiang SX, Wang YJ, Bian YL, Chen JJ and Jia B. Genetic Analysis of the Resistance to Aspergillus flavus Infection in Maize (Zea mays L.), Agricultural Sciences in Chian, 2009 Vol.8 (No.6)：761-765

　　28. Yu HX, Lu MF, Chen XH, Gong ZY, Liu QQ* and Gu MH*. (2009). Efficiencies of generating selectable marker-free transgenic rice with different transformation methods, Rice Science, 16: 254–260.

　　29. Zuo SM, Wang ZB, Chen XJ, Gu F, Zhang YF, Chen ZX, Pan X B*, and Cun-Hong PAN (2009). Evaluation of Resistance of a Novel Rice Line YSBR1 to Sheath Blight. Acta Agronomica Sinica, 35(4): 608-614

　　30. Wang XF, Song W, Tang ZX, Wang YM, Xu CW*. Interval mapping of quantitative trait loci underlying endosperm traits with NCIII and TTC designs. Acta Agronomica Sinica, 2008, 34(10): 1734 -1743

　　 

非SCI论文：

　　1.骆汝九，胡治球，宋雯，徐辰武*. 多性状综合评定的秩和测验方法及其应用. 中国农业科学，2009，42（8）：2686-2694

　　2.王新其，殷丽青，沈革志*，徐丽，刘巧泉. 反义蜡质基因纯合株系间直链淀粉含量与RVA谱关系分析. 中国农业科学，2009，42(6)：1881-1888[**]

　　3.陈志军，汤在祥，宋雯，徐辰武*. 基于遗传位置的水稻和玉米重要农艺性状的QTL比较研究. 中国水稻科学，2009，23（3）：229-236

　　4.张宏根，朱正斌，李波，刘超，汤述翥*，梁国华，顾铭洪. 粳稻野败型细胞质雄性不育恢复系SWR78的恢复基因定位. 中国水稻科学，2009，23(4)：377-382

　　5.张宏根，李波，朱正斌，崔小芬，汤述翥*，梁国华，顾铭洪. 分子标记辅助选择改良武育粳3号的条纹叶枯病抗性. 中国水稻科学，2009,23(3):263~270

　　6.李钱峰，张桂云，于恒秀，辛世文，顾铭洪，刘巧泉*. 水稻异淀粉酶基因ISA1及其启动子的表达特性分析. 中国水稻科学，2009, 23(1)：12-18

　　7.于恒秀，陆美芳，陈秀花，龚志云，刘巧泉*，顾铭洪*. 同转化方法培育无抗性选择标记转基因水稻效率的比较. 中国水稻科学, 2009, 23(2)：120-126

　　8.卞云龙，杜凯，王益军，邓德祥*. 玉米茎秆糖含量的分布. 作物学报. 2009，35（12）：2252-2257

　　9.王亚民，汤在祥，陆鑫，徐辰武*. 基于贝叶斯统计的谷物胚乳性状QTL区间作图方法. 作物学报，2009，35（9）：1569-1575

　　10.周丽慧，刘巧泉，张昌泉，徐勇，汤述翥，顾铭洪*,. 水稻种子蛋白质含量及组分在品种间的变异与分布. 作物学报，2009，35（5）：884-891

　　11.周丽慧，刘巧泉，顾铭洪*, 不同粒型稻米碾磨特性及蛋白质分布的比较. 作物学报，2009，35(2): 317-323

　　12.于恒秀，刘巧泉*，徐丽，陆美芳，蔡秀玲，龚志云，裔传灯，王宗阳，顾铭洪*. 无抗性选择标记转基因软米和糯稻新品系的选育及中间试验. 作物学报, 2009, 35(6): 967−973

　　13.殷跃军，左示敏，王辉，张亚芳，陈宗祥，马玉银，顾世梁、潘学彪*. 抗水稻纹枯病qSB-9~(Tq)基因效应及作用方式分析，作物学报 2009, 35（2）：279−285

　　14.左示敏，王子斌，陈夕军，顾芳，张亚芳，陈宗祥，潘学彪*. 水稻纹枯病改良新抗源YSBR1的抗性评价. 作物学报 2009, 35（4）：608-614

　　15.潘学彪*，陈宗祥，左示敏，张亚芳，吴旭江，马宁，江祺祥，阙金华，周春和. 以分子标记辅助选择育成抗条纹叶枯病水稻新品种“武陵粳1号”. 作物学报 2009, 35（10）：1851-1857

　　16.潘存红，李爱宏，陈宗祥，吴林波，戴正元，张洪熙，黄年生，陈夕军，张亚芳，左示敏、潘学彪*. 水稻黑条矮缩病抗性QTL分析. 作物学报 2009, 35（12）：1−5

　　17.王子斌，左示敏，李刚，陈夕军，陈宗祥，张亚芳，潘学彪*. 水稻抗纹枯病苗期快速鉴定技术研究. 植物病理学报 2009, 39（2）：174-182

　　18.陈夕军、王玲、左示敏、王子斌、陈宗祥、张亚芳、鲁国东、周而勋、郭泽建、黄世文、潘学彪*. 水稻纹枯病寄主-病原物互作鉴别品种与菌株的筛选. 植物病理学报 2009, 39（5）：514-520

　　19.高清松，杨泽峰，徐辰武*. 水稻基因组进化的研究进展. 扬州大学学报（农业与生命科学版），2009，30（2）：34-44

　　20.蒋思霞，邓德祥*，王益军，卞云龙，陈坚剑，贾波. 玉米抗黄曲霉菌的基因位点及效应分析. 扬州大学学报（农业与生命科学版） 2009 30（3）：11-15

　　21.秦泰辰*，邓德祥，卞云龙，高油玉米育种与应用探讨. 现代农业科技，2009，10

　　22.秦泰辰*，邓德祥，卞云龙. 紫糯玉米遗传与育种探讨. 现代农业科技，2009，11

　　23.蒋守华，邓德祥*，刘葛山等. 多叶玉米主要性状杂种优势及配合力分析. 天津农学院学报，2009，12

　　24.白青海*， 徐寿军， 董永义，许如根， 庄恒扬. 大麦叶面积指数的模拟研究. 生物数学学报，2009（2）：321-328 [**]

　　25.敖雁，胡治球，汤在祥，王学枫，徐辰武*. 双亲本杂交衍生的多个相关群体QTL图的联合构建方法. 麦类作物学报，2009，29（4）：553-558

　　26.吕超, 黄祖六, 祝丽, 汤在祥, 许如根*. 大麦开颖性状的遗传分析Ⅲ．大麦开颖基因的等位性及非等位基因间的互作. 麦类作物学报..2009，29（3）：369-373

　　27.韦存虚, 张军, 周卫东 ,陈义芳, 许如根*. 大麦胚乳发育过程中贮藏蛋白的积累和蛋白体的形成. 作物学报,2009, 35(2)：334-340

　　28.汤述翥*, 张宏根, 朱正斌, 刘巧泉, 梁国华, 严长杰, 刘　超, 李　鹏, 顾铭洪. 红莲型不育细胞质应用于粳稻杂种优势的思考与初探. 西南农业学报，2009，22（4）：1158-1164

　　29.汤  湘，刘巧泉，唐威华*. 激光显微切割技术推进全面解析植物雄配子发生的分子机制. 细胞生物学杂志，2009, 31(2): 151-156 [**]

　　30.周丽慧，张昌泉，刘巧泉*，顾铭洪*. 具不同蛋白质含量水稻品种中天冬酰胺合成酶基因的表达. 基因组学与应用物学，2009，28(1)：39-45

　　31.顾铭洪*，刘巧泉. 作物分子设计育种及其发展前景分析. 扬州大学学报（农业与生命科学版），2009，30(1)：64-67

　　32.周丽慧，刘巧泉，张昌泉，徐勇，汤述翥，顾铭洪*, 不同方法测定水稻种子蛋白质含量及其相关性. 扬州大学学报（农业与生命科学版），2009，30(1)：68-72

　　33.马玉银，李磊，张亚芳，潘存红，左示敏，李爱宏，陈宗祥，潘学彪*. 一个水稻小粒矮突变体的候选基因分析. 扬州大学学报(农业与生命科学版) 2009, 30（2）：45-49，94

　　34.李爱宏，戴正元，季红娟，张小祥，李育红，潘存红，张洪熙*，潘学彪*. 籼型杂交水稻黑条矮缩病抗性配合力分析. 扬州大学学报(农业与生命科学版) 2009, 30（1）：73-77

　　35.王子斌，左示敏，李刚，陈夕军，陈宗祥，张亚芳，潘学彪*. 水稻纹枯病几种田间病级调查标准的比较研究. 扬州大学学报(农业与生命科学版) 2009, 30（4）：9-14

　　36.顾世梁，潘学彪*，左示敏，张亚芳，殷跃军，王子斌，童蕴慧，陈夕军. 水稻抗纹枯病主效数量基因的鉴定与克隆. 中国科技成果,2009, DOI:10.3772/j.ISSN