学院目前承担各类各级科研项目391项，其中国家级项目135项，在研项目总经费3.075亿元，年人均科研经费85.46万元。

近5年，教师主编，参编出版教材、学术专著34篇；发表SCI论文数达890篇，其中一区，二区论文672篇，高影响因子论文（IF>5）440篇。申请发明专利126项，授权发明专利53项，育成新品种28个，获国家版权局计算机软件著作104项。共获得部省级以上科学技术奖36项，其中以第一完成单位获国家自然科学奖二等奖1项，以第一、第二完成单位获国家科技进步奖二等奖2项。

  平台建设稳步发展。2014年，江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点通过中期考核评估，并获新一轮培育建设，2018年通过考核验收，获优秀等次；2016年，植物功能基因组学教育部重点实验室通过教育部新一轮评估；2018年，江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心由培育转为正式立项建设；2018年，江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室获批立项建设；2020年，江苏省优质粳稻产业工程研究中心获批立项建设；2022年，农业农村部盐碱土改良与利用（滨海盐碱地）重点实验室”成功入选农业农村部学科群重点实验室；2023年，生物育种钟山实验室正式成立。此外，新增全国粮食安全宣传教育基地、江苏扬州国家科技特派员创业培训基地、农业部长江中下游地区作物栽培科学观测实验站各1个。